Министерство природных ресурсов и экологии Российской Федерации

Почвы заповедника разнообразны, и их распределение по территории подчиняется строгим закономерностям.

На наиболее высоких формах рельефа — вершинах сельг — сформировались фрагментарные почвы начальных стадий почвообразования. Склоны сельг сложены плащом сильно завалуненной морены со слаборазвитыми почвами. Крутые склоны заняты примитивным неоподзоленным почвоэлювием и карликовыми малоразвитыми подзолами. На плоских склонах под сосновыми лесами сформировались маломощные языковатые и карманистые подзолы с гумусово-железистым иллювиальным горизонтом, а под лиственными лесами — вторичные дерново-подзолистые почвы.

На ленточных слоистых глинах в условиях избыточного увлажнения формируются торфянисто- и торфяно-подзолисто-глеевые почвы; на плоских и крутых склонах — дерновые поверхностно-глеевые и глееватые неоподзоленные почвы; в замкнутых бессточных понижениях рельефа — торфяно-болотные почвы.

Под пологом сосновых боров на песках сформировались поверхностно-подзолистые почвы. При выровненном залегании под сосняками-черничниками формируются маломощные иллювиально-железистые подзолы, в более влажных условиях — торфянистые иллювиально-гумусовые подзолы, в плоских понижениях и по периферии болот — торфянисто-подзолистые почвы.