К редким и находящимся под угрозой исчезновения представителям ихтиофауны, обнаруженным в Государственном природном заповеднике «Кивач» относятся атлантический лосось (пресноводная форма = озёрный лосось) и ручьевая форель. Оба вида включены в Красную книгу Республики Карелия (2020), а атлантический лосось - в Красную книгу Российской Федерации (2020).
- По числу видов преобладает семейство карповые, включающее 10 видов (32,3%), среди которых лещ, елец, язь, плотва, уклейка, густера, карась, пескарь, краснопёрка, голавль.
- Четырьмя видами представлено семейство лососёвые (атлантический лосось, радужная форель, кумжа, палия).
- Тремя видами представлено семейство окунёвые (окунь, судак, ёрш) и керчаковые (обыкновенный и пестроногий подкаменщики, четырёхрогий бычок-рогатка).
- По 2 вида включают семейства сиговые (европейский сиг, европейская ряпушка), колюшковые (трёхиглая и девятииглая колюшки).
- Одним видом представлены семейства миноговые (европейская ручьевая минога); хариусовые (европейский хариус); корюшковые (европейская корюшка); щуковые (обыкновенная щука); угреобразные (речной угорь); вьюновые (обыкновенная щиповка); балиториевые (усатый голец); налимовые (налим).
- Пять видов рыб (15,6%) относится к арктическому пресноводному комплексу – палия, сиг, ряпушка, корюшка, налим.
- Наибольшее число видов (34,4%) насчитывается в бореальном равнинном комплексе – щука, язь, елец, плотва, пескарь, обыкновенный карась, ёрш, окунь, щиповка, голавль.
- Бореальный предгорный фаунистический комплекс представлен пятью видами рыб (15,6%) – лосось, форель, хариус, усатый голец, обыкновенный подкаменщик.
- Понтический пресноводный комплекс включает 4 вида рыб – лещ, уклея, густера, краснопѐрка. Два вида (судак и речной угорь) относятся к древнему верхнетретичному фаунистическому комплексу.
По материалам статьи Э.К. Попова, А.В. Сухов "ИХТИОФАУНА ВОДОЁМОВ ЗАПОВЕДНИКА «КИВАЧ». Труды государственного природного заповедника "Кивач", 5 выпуск, Петрозаводск, 2011 г.